- IE 1 – Linéaire de ripisylve en déséquilibre
- IE 2 – Affleurement du substratum
- IE 3 – Recharge du lit mineur
- IE 4 – Colonisation par les espèces exotiques terrestres
- IE 5 – Colonisation par les espèces exotiques aquatiques
- IE 6 – Discontinuité de la ripisylve
- IE 7 – Linéaire de cours d’eau scindés
- IE 8 – Linéaire de substrats / faciès homogènes
- IE 9 – Tronçons de cours d’eau naturels priorisés
- IE 10 – Nombre d’ouvrages en mauvais état
- IE 11 – Nombre d’obstacles à la continuité écologique
- IE 12 – Obstacles à la transparence sédimentaire : nombre et linéaire de substrats homogènes
- IE 13 – Densité d’embâcles gênants